手术室净化工程的控制要点主要分为了设备质量的控制、材料控制以及建设后的维护控制，首先要选择经过专业培训的施工队伍，由于手术室净化工程当中涉及到暖通工程以及电气和医用气体等类知识，因此施工人员必须对净化工程的流程和相关施工规范和工艺予以了解，下面小编就告诉您手术室净化工程的主要控制要点。
一、室内密封控制
手术室净化工程的室内密封控制要比普通的手术室更加严格，其重点是维护结构密封施工质量，板材的选择极其关键，除此之外便是板材与板材之间的均匀和密闭性，尽量选择同类板材，拼接板材中要使用密封胶进行密封，并且使用专业设备保证板材之间的严丝合缝，部分特殊手术室净化工程需要采用一体化板材。
二、送回风管道控制
价格实惠的手术室净化工程的要点之一为将外界空气与手术室内的空气进行隔绝，因此送回风管的质量控制极其关键，为了避免室外的污空气进入风管，也为了避免空气渗透，必须要用高效的过滤器对手术室净化工程中管道施工和设备安装的质量控制，必须要求对送风管道空气进行有效控制。
三、施工清洁性控制
为了避免可信赖的手术室净化工程大量繁杂后续工程，前期施工过程中就需着重注意，首先要使用平整光滑的材料尽量减少尘土的产生，手术室净化工程原则上不可采用纤维掉渣材料，同时要求施工材料具有一定的吸潮性和无污染性，不可使用松散材料，必须使用纤维材料时则需使用为毡式材料。
同时手术室净化工程施工结束后要对整体的施工质量进行复检，即便是由专业施工团队全程监督施工，也难免在施工过程当中与预定的施工方案有所冲突，而此时后期的质量检验工作至关重要，它并非为形式化的检验，而是要切实对整个净化工程系统的可实施性和后期效果进行检查。